Eröffnet 1972 am Institut für Meereskunde in Kiel präsentiert Ihnen das Aquarium in 32 Becken einen Querschnitt durch die Fauna der Ozeane.

Spezialisiert ist das Aquarium auf Vertreter der kalten und Flachwassermeere, wie Nordsee, Ostsee und Nordatlantik. Dies ist für ein Aquarium außergewöhnlich, da die Fische in zum Teil sehr aufwendig gekühlten Becken gehalten werden müssen. So können Sie im Kieler Aquarium selten gezeigte Exemplare, wie Dorsche, Steinbutte, Seehasen, Seewölfe und Hummer bewundern. Ein großes Rundbecken ist die Heimat für einen ganzen Heringsschwarm. An Säugetieren hält das Kieler Aquarium Seehunde in drei Außenbecken.
Daneben werden Schleswig-Holsteinische Süßwasserfische gezeigt und eine Vielzahl an Tieren aus allen Weltmeeren. 
Als besondere Attraktion ist es dem Besucher möglich, einen Blick hinter die Kulissen zu werfen und Einblick in die ausgeklügelte Technologie eines modernen Aquariums zu erhalten.